Asociaciones fenotipo-genotipo de polimorfismos en genes relevantes a obesidad en mexicanos del Proyecto oriGen

Abstract

La obesidad es una enfermedad multifactorial cuya prevalencia en México ha aumentado del 23% en el año 2000 al 36% en 2018. Su desarrollo involucra factores ambientales y genéticos, sin embargo, la mayoría de los estudios de asociación genética han sido realizados en cohortes con baja representación latinoamericana. Este estudio tuvo como objetivo identificar asociaciones significativas entre genes asociados a obesidad y fenotipos en una cohorte de 1,427 participantes mexicanos del Proyecto oriGen, una iniciativa del Tecnológico de Monterrey para construir una base de datos genómicos y epidemiológicos de 100,000 mexicanos. Se definieron 34 genes asociados a obesidad y 1 asociado a diabetes tipo 2 (DT2) en población latinoamericana, identificándose 13,975 variantes. Tras filtrar variantes con alta correlación por ligamiento de desequilibrio (r2), se analizaron 10,250 variantes con 938 fenotipos obtenidos del cuestionario aplicado a los participantes en el Proyecto oriGen. Se generaron 9,614,500 asociaciones fenotipogenotipo, de las cuales 5,080 resultaron significativas tras pruebas estadísticas (Chi-cuadrado y Fisher) y corrección por falsos descubrimiento (FDR) con el paquete Independent Hypothesis Weighting (IHW) en R. Entre los hallazgos se replicaron asociaciones previamente reportadas para el fenotipo de obesidad en 11 genes (FTO, NEGR1, NRP2, ADCY3, PPARG, SEMA3F, LEPR, PLXNA2, GIPR, CADM1 y CADM2), y se identificaron asociaciones potencialmente novedosas en SEMA3F, SEMA3E, GPRC5B y PLXNA2. Este trabajo proporciona evidencia sobre asociaciones específicas en población mexicana, junto con una estrategia automatizada y escalable para su identificación. Los hallazgos contribuyen a la comprensión de mecanismos moleculares implicados en obesidad y al desarrollo de terapias dirigidas a la población mexicana.