Ciencias Exactas y Ciencias de la Salud
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11285/551039
Pertenecen a esta colección Tesis y Trabajos de grado de las Maestrías correspondientes a las Escuelas de Ingeniería y Ciencias así como a Medicina y Ciencias de la Salud.
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- Development of a screening method for identifying potential aminoglycosides producers from a collection of environmental Actinobacteria(Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, 2020-12-02) González Salazar, Luz Ángela; Licona Cassani, Cuauhtémoc; puelquio/tolmquevedo; Pacheco Moscoa, Adriana; De la Torre Zavala, Susana; Cruz Morales, Pablo; Escuela de Ingeniería y Ciencias; Campus MonterreyNature represents an important source of molecules with relevant applications in agriculture, industrial and health. Although many efforts have been performed in the identification of new natural products, target, and efficient strategies to select NPs producers are still needed. Previous studies have shown that the intrinsic resistance of Actinobacteria that produce antimicrobial agents could be used as a systematic approach for the detection antibiotics producers. Therefore, the aim of this work was to test different resistance, molecular and bioinformatic analysis as selection criteria to identify possible candidates to produce aminoglycoside antibiotics. This is the first approach developed for this class of antibiotics. we generated a collection of environmental strains and standardized some conditions using model strain producers. We could standardize the procedure for molecular screening in model producers, but we did not find evidence of aminoglycoside producers for the environmental collection, this fact supported by resistance and bioinformatic analysis. According to this, an improved strategy was proposed combining field-directed sampling, an improved molecular screening, as well as the selection of bioinformatic tools with high detection sensibility to AGs BGCs. Additionally, a huge diversity of BGCs from other chemical families was observed according to the genome mining analysis. These results represent an opportunity to continue exploring the chemical diversity in Actinobacteria isolated from unique regions that can be studied as well as being the inspiration for the development of new screening protocols.
- Design and characterization of a biosensor for the detection of aminoglycoside compounds with codon-readthrough activity.(Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey) Trejo Alarcón, Luisa María; LICONA CASSANI, CUAUHTEMOC; 176857; Licona Cassani, Cuauhtémoc; emipsanchez; Aguilar Yáñez, José Manuel; Utrilla Carreri, José; Biotecnología; Campus Monterrey; Cruz Morales, PabloLas enfermedades raras o huérfanas se presentan en 5 de cada 10,000 individuos y son atribuidas en su gran mayoría a desordenes genéticos (80%); mientras que el resto son cánceres poco frecuentes, malformaciones congénitas e infecciosas, enfermedades autoinmunitarias y metabólicas; las cuales representan un problema de salud mundial ya que, al ser tan diversas entre sí, el desarrollo de fármacos para su tratamiento es escaso (solo el 5% tienen tratamiento) y aproximadamente 350 millones de la población mundial presenta afecciones de este tipo. La Distrofia Muscular de Duchenne (DMD) entra dentro de esta clasificación, al ser una enfermedad genética hereditaria, que produce un codón prematuro de terminación (PTC) en el gen que codifica para la producción de la proteína distrofina; en los años 1990s se descubrió que los aminoglucósidos (AGs) tienen potencial terapéutico para este tipo de enfermedades, ya que propician el fenómeno conocido como codon-readthrough (CR), provocando la restauración del gen afectado; sin embargo, su uso durante largos periodos de tiempo provoca ototoxicidad y nefrotoxicidad. Debido a lo anterior surgió la necesidad de descubrir nuevos productos naturales con actividad de aminoglucósido, provenientes principalmente de Actinomicetos. Actualmente las estrategias de detección de nuevos metabolitos comprenden el aislamiento, cultivo y extracción utilizando diferentes medios de cultivo; métodos de screening para detectar su bioactividad y el uso de herramientas bioinformáticas para la identificación de clusters de genes de biosíntesis (BGCs); sin embargo son procesos muy largos, costosos y carecen de especificidad al no estar encaminados a la detección de procesos celulares especializados; por lo que la industria farmacéutica ha dejado de invertir en su investigación y desarrollo. El presente trabajo describe a detalle el desarrollo un sistema de screening eficiente y mejorado con respecto a los a existentes, para la detección de moléculas con actividad de aminoglucósidos basado en CR; mediante la generación de un biosensor dentro de la levadura Saccharomyces cerevisiae utilizando un arreglo de biología sintética compuesto por los genes reporteros de crecimiento URA3 y luminiscencia Nluc.